Wcześniej, w ramach obchodów, odbył się konkurs recytatorski pt. „O Księdzu Jerzym wierszem”, organizowany przez parafię i Gimnazjum nr 2 we Włocławku, którego patronem jest bł. Jerzy Popiełuszko. O godz. 15 Koronkę do Bożego Miłosierdzia poprowadził proboszcz parafii i kustosz powstającego sanktuarium o. Kamil M. Kraciuk CCG. Następnie, z udziałem bp. seniora Bronisława Dembowskiego – inicjatora krzewienia w parafii MB Fatimskiej kultu kapłana męczennika – trwało modlitewne czuwanie i adoracja relikwii błogosławionego. Towarzyszyły temu śpiewy w wykonaniu zespołu Agni ze Szpetala Górnego i chóru parafialnego pod dyrekcją Dariusza Gliszczyńskiego, organisty.
Centrum uroczystości stanowiła Eucharystia pod przewodnictwem biskupa Dembowskiego, podczas której homilię wygłosił wicerektor WSD we Włocławku ks. Jarosław Szpolorowski. Z kapłanów celebrujących i obecnych na Mszy św. wymieńmy przynajmniej dziekanów obydwu dekanatów włocławskich: ks. prał. Teodora Lenkiewicza i ks. prał. Kazimierza Grabowskiego, wicedziekana drugiego dekanatu włocławskiego ks. Lesława Politowskiego i o. Hieronima Tarłowskiego OFM z parafii Wszystkich Świętych we Włocławku, a także prowincjała Zgromadzenia Braci Pocieszycieli z Getsemani o. Świerada M. Pettke CCG i o. proboszcza Kamila M. Kraciuka CCG.
Z parafianami w Eucharystii uczestniczyli goście, wśród nich przedstawiciele władz państwowych, miejskich i samorządowych. Licznie przybyły siostry zakonne, a pod sztandarami – poczty związków zawodowych, szkół i zakładów pracy. Witając wszystkich o. Świerad M. Pettke CCG wyraził radość, że to biskup Dembowski odprawiać będzie pierwszą Mszę św. w nowym kościele i podziękował mu za podjętą przed laty decyzję. Dzięki niej coraz powszechniej i głębiej rozumiana jest idea tworzenia sanktuarium męczeństwa bł. księdza Jerzego. – Proces formalnej akceptacji sanktuarium zazwyczaj jest długotrwały i wymaga weryfikacji. Wydaje się jednak, że w wypadku naszego sanktuarium, intuicja parafian i licznych pielgrzymów wyprzedziła oficjalne orzeczenie władz kościelnych – stwierdził o. prowincjał.
Po Mszy św. udano się w procesji do Krzyża na tamie wiślanej. W drodze Różaniec prowadził o. Szymon M. Korytowski CCG. Na miejscu, po modlitwie do bł. Jerzego Popiełuszki biskup Dembowski pobłogosławił wiernych relikwiarzem. Podniosłą uroczystość zakończyła ceremonia składania wieńców pod Krzyżem.